נתן שרוני נולד בשנת 1934 בישראל. בשנת 1952 התגייס לצה"ל ושירת בחיל התותחנים. במהלך שירות החובה הוסמך לקצונה ובמערכת סיני פיקד על סוללת תותחים. בסוף שנות החמישים למד בבית הספר לתותחנות בצבא ארצות הברית ובשנים 1962-1960 שימש סגן מפקד גדוד תותחים 404.
בשנים 1963-1962 שימש כקצין המבצעים של אגד ארטילרי 215 ובשנים 1964-1963 היה חניך במכללה הבין זרועית לפיקוד ומטה (פו"ם). בשנים 1966-1964 פיקד על גדוד תותחים 403 ובשנים 1967-1966 שימש מדריך בפו"ם. במלחמת ששת הימים פיקד על גדוד תותחים 871 ולחם עמו במערכה לכיבוש רמת הגולן. בשנים 1969-1967 פיקד על אגד ארטילרי 215 ובשנים 1970-1969 פיקד על אגד ארטילרי 209, ובמסגרת שני תפקידים אלו השתתף במלחמת ההתשה.
בשנים 1972-1970 עמד בראש מחלקת תורת לחימה במחלקת ההדרכה במטה הכללי ובמינוי משני פיקד על אגד ארטילרי 212. בשנים 1973-1972 עמד בראש מטה פיקוד הדרום בדרגת תת אלוף. בשנים 1976-1973 שימש כקצין תותחנים ראשי וכמפקד החיל היה אמון על בניין כוחו. במהלך כהונתו פרצה מלחמת יום הכיפורים ותחת פיקודו הפעיל החיל עשרות גדודי ארטילריה, שהעניקו סיוע לאוגדות המתמרנות בקרבות הבלימה וההבקעה בשתי החזיתות. לאחר המלחמה פעל לשיקום החיל ולהטמעת לקחי המלחמה במערכיו.
בשנים 1978-1976 שימש כעוזר ראש אג"ם ובשנים 1981-1978 עמד בראש אגף התכנון במטה הכללי בדרגת אלוף. בשנת 1982 השתחרר משירות קבע בצה"ל.